Was für ein Rundflug ist das denn? Hubschrauber oder 1-motorig, wo du dem Piloten evtl. Anweisungen geben kannst? Was größeres, schnelleres oder einfach nur ein Airliner?
Die EOS 1000D hat einen ISO Bereich bis 1600. Die Bilder bei ISO 1600 sehen echt krass verrauscht aus, aber das musst du wohl fast in Kauf nehmen, wie schon geschrieben, lieber rauschen und "scharf" als verwackelt. Dein Kit Objektiv hat vermutlich keinen Bildstabilisator (= IS) oder? Lichtstark ist es leider auch nicht.
Als Einstellungen empfehl ich dir erstmal folgendes:
Modus AV, Blende auf 3,5 (mehr geht nicht) und Iso auf 1600. Die Kamera belichtet dann so lange wie nötig. Ob du (oder das Flugzeug^^) diese Zeit halten kannst ist eine andere Frage.
Theoretisch sagt man, dass man Freihand eine Zeit von 1/(Kleinbild Brennweite in mm) halten kann. Bei dir sind das bei 18mm: 1/(18 * 1,6) = ca. 1/30s Wenn du weiter vom Flugzeug entfernte Objekte ablichten willst, dann kann diese Zeit schon reichen, da sie sich relativ zum Flieger nicht so sehr bewegen, sofern du mit einer kleinen Cessna unterwegs bist. Allerdings ist auch fraglich ob es für die 1/30 Belichtungszeit hell genug ist. Da hilft nur ausprobieren. Bei Dunkelheit mal auf ein Hochhaus/Parkdeck/Hügel gehen und schauen was du für Zeiten erreichst.
Auf jeden Fall solltest du die Bilder sofort auf dem Display kontrollieren und bei einer zu langen Belichtungszeit der Kamera über die Belichtungskorrektur 1 bis 2 Stufen herunterregeln (dann wird kürzer belichtet = dunkler, aber weniger verwackelt). Die Belichtungsautomatik der Canons wählt oft viel zu lange Zeiten und will die Bilder gerade bei Nacht-/Dämmerungsaufnahmen unnötig hell machen.
Wenn die Belichtungskorrektur nicht ausreicht, dann wechsle auf M und stelle die 3,5er Blende und ISO 1600 da ein. Mit der Belichtungszeit einfach experimentieren.
Trotz all dieser Hinweise, bin ich eher pessimistisch, dass das reicht. Weder Kamera noch Objektiv sind wirklich lichtstark und für diese Extrembedingungen gemacht. Möchtest du noch etwas Geld investieren, dann kannst du mal über ein besseres Objektiv nachdenken zB das Tamron 17-50 F2,8 (
http://www.amazon.de/Tamron-17-50mm-digitales-Objektiv-Canon/dp/B000FZ3FY8/ref=sr_1_2?s=ce-de&ie=UTF8&qid=1329301378&sr=1-2). Das lohnt sich aber wohl nur, wenn du es auch außerhalb dieses einen Fluges benutzen würdest. Nochmal deutlich lichtstärker wäre das Canon 50mm, f1,8 (
http://www.amazon.de/Canon-EF-50mm-Objektiv-Filtergewinde/dp/B00005K47X/ref=sr_1_1?ie=UTF8&qid=1329301277&sr=8-1). Das ermöglicht dir keine Panorama Bilder (50mm Festbrennweite, kein Zoom) , aber für die gebotene Lichtstärke ist es sehr sehr billig (neu 100€, gebraucht 75€ im DSLR Forum) und bei Gebrauchtkauf ohne Verlust wieder loszuwerden.
Ein weiteres Problem werden die Reflexionen sein. Im Cockpit leuchtet alles mögliche und spiegelt sich dann in der Scheibe und den Bildern. Da hilft nur die Linse komplett (!) auf die Scheibe aufzusetzen. Dann ist der Blickwinkel natürlich eingeschränkt. Verhindern kann man dies mit flexiblen Gegenlichtblenden aus Gummi (teuer, eher unnötig) oder einem neuen
Pümpel/Klostampfer. Den aufschneiden, das Objektiv durchstecken und du hast einen flexiblen, an der Scheibe aufliegenden Blendschutz. Desweiteren solltest du alle Filter (UV, Polfilfter) abschrauben, da sie nur Licht schlucken und nachts Doppelbilder verursachen.